Управление на транспорте МВД России по Северо-Кавказскому федеральному округу тесно взаимодействует как с организациями правоохранительной направленности, так и с органами исполнительной власти, местного самоуправления и другими учреждениями и организациями по вопросам оперативно-служебной деятельности.
Так в 2020 году представители Управления входили в состав следующих комиссий при Правительстве Ростовской области:
- Областная межведомственная коммиссия по профилактике правонарушений.
- Межведомственная комиссия по делам несовершеннолетних и защите их прав.